利用试样中各组份在气相和固定液-液相间的分配系数不同，当汽化后的试样被载气带入
气相色谱仪色谱柱中运行时，组份就在其中的两相间进行反复多次分配，由于固定相对各组份的吸附或溶解能力不同，因此各组份在色谱柱中的运行速度就不同，经过一定的柱长后，便彼此分离，按顺序离开色谱柱进入检测器，产生的离子流讯号经放大后，在记录器上描绘出各组份的色谱峰。
气相色谱仪试验使用的用以传输气体的管路的材质多种多样。一般有聚四氟乙烯材质、铜管、不锈钢管路三种：
1.聚四氟乙烯（PTFE）管路
该材质管路价格便宜，使用广泛。一般而言，聚四氟乙烯管路具有化学惰性，适用于气路低压的情况。目前，国内相当一部分气相色谱厂家仪器配置该种类型气体管路。除了可以用以连接气源、净化器和气相色谱之外，还可以用以作为驱动气动六通阀气缸转动的驱动气的管路。常用聚四氟乙烯管路的外径一般为3mm，内径为2mm。聚四氟乙烯管路有多种颜色，一般为白色，也有其他颜色的聚四氟乙烯管路，主要用以标记和表示不同的气体类型，便于区分和识别。
2.铜管
使用铜管作为气路管较不锈钢管来说相对便宜，相对聚四氟乙烯管路，其不易腐蚀，耐高温，耐高压；化学性质稳定；易弯曲，韧性好且延展性高，具有优良的抗振、抗冲击及抗冻性能；外表光亮，内壁清洁。除可以用以连接气源、净化器和气相色谱之外，还可以作为分流出口到分流放空捕集阱的连接管线。
3.不锈钢管路
常用不锈钢管路的类型为316不锈钢，因添加Mo元素，使其耐蚀性、和高温强度有较大的提高，可在苛酷的条件下使用。对于不锈钢管路来说，其具有铜管路的所有的优点；特别需要注意的是，同样规格的不锈钢管路要比铜管路硬度高，这样就避免了铜管反复拆装过程中带来的变形和易折断的缺点。相对于聚四氟乙烯管路和铜管而言，不锈钢管路的价格是最贵的。
